Информация

Какво е функционална дисекция?

Какво е функционална дисекция?


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Четейки [1] Намерих изречението:

Последователно, функционалната дисекция на миши и човешки диви тип и мутантни RAS изогенни левкемични клетки демонстрира индукция на резистентност към метотрексат, но също така подобрява отговора към винкристин в мутантни RAS-експресиращи лимфобласти.

Все още не намерих определение онлайн. Какво е значението на функционалната дисекция в този контекст?

[1] K. Oshima et al., “Мутационен пейзаж, модели на клонова еволюция и роля на RAS мутациите при рецидивираща остра лимфобластна левкемия,” Proc Natl Acad Sci USA, vol. 113, бр. 40, стр. 11306-11311, октомври 2016 г.


Терминът „функционален“ в този контекст предполага вид анализ, който е в състояние да осигури механистично разбиране.

Авторите първо описват своя изследователски подход, чрез който идентифицират някои гени и техните мутации, които са свързани с рецидив на пациента при остра лимфобластна левкемия. След това те продължават да се намесват в системата, като експресират мутирал KRAS в мишки. Когато направиха това, те забелязаха няколко отличителни белега на рецидив при тези мишки. Следователно те могат да заключат, че мутация на този ген е включена в механизъм което е в основата на рецидива.

По този начин начинът, по който тези автори използват термина „функционален анализ“/„функционална дисекция“ е в контраст с корелационни Приближаване.


Основното предположение е, че като изолираме части от системата и изучаваме техните свойства и ефектите им, ще можем да разберем физическия свят. Това е философска (метафизична) теза, наречена редукционизъм, което може би е преобладаващото мнение в естествените науки.

Първата употреба на термина "функционална дисекция", която успях да намеря, е в статия от 1971 г. за имунологичния отговор на малки молекули. Тяхната цел в този документ беше да отделят (или дисектират) ефектите на малки молекули, като говежди глюкагон, върху специфичността на антителата спрямо производството на антитела. Те са открили, че различни части на тази молекула са отговорни за антигенната специфичност (всички антитела разпознават N-терминала) и клетъчния имунитет (най-вече С-терминалът на молекулата е свързан със синтеза на ДНК).


Функционално разстройство

А функционално разстройство е медицинско състояние, което нарушава нормалното функциониране на телесните процеси, което остава до голяма степен неоткрито при изследване, дисекция или дори под микроскоп. Отвън няма аномалия. Това е в контраст с a структурно разстройство (при което може да се види, че част от тялото е анормална) или психосоматично разстройство (при което симптомите са причинени от психологическо или психиатрично заболяване). Определенията се различават донякъде в различните области на медицината.

Като цяло механизмът, който причинява функционално разстройство, е неизвестен, слабо разбран или понякога маловажен за целите на лечението. Често се смята, че участват мозъкът или нервите. Обичайно е човек с едно функционално разстройство да има и други.


Съдържание

Растителните и животинските тела се дисектират, за да се анализира структурата и функцията на неговите компоненти. Дисекцията се практикува от студенти в курсове по биология, ботаника, зоология и ветеринарни науки, а понякога и в изкуства. В медицинските училища студентите дисектират човешки трупове, за да научат анатомия. [1]

Дисекцията се използва за определяне на причината за смъртта при аутопсия (наречена аутопсия при други животни) и е неразделна част от съдебната медицина. [2]

Ключов принцип при дисекцията на човешки трупове е предотвратяването на човешки заболявания на дисектора. Предотвратяването на предаването включва носенето на защитно облекло, осигуряване на чиста среда, техника на дисекция [3] и тестове преди дисекция на проби за наличие на ХИВ и вируси на хепатит. [4] Пробите се дисектират в моргите или в лабораториите по анатомия. Когато са предоставени, те се оценяват за използване като "пресни" или "подготвени" екземпляри. [4] „Свеж“ екземпляр може да бъде дисектиран в рамките на няколко дни, запазвайки характеристиките на жив екземпляр, за целите на обучението. „Подготвен” образец може да бъде запазен в разтвори като формалин и предварително дисектиран от опитен анатом, понякога с помощта на диенер. [4] Тази подготовка понякога се нарича просекция. [5]

Повечето дисекция включва внимателно изолиране и отстраняване на отделни органи, наречена техника на Вирхов. [3] [6] Една алтернативна по-тромава техника включва отстраняване на цялото тяло на органа, наречена техника Letulle. Тази техника позволява тялото да бъде изпратено до погребалния директор, без да се чака понякога отнемащата време дисекция на отделни органи. [3] Методът на Рокитански включва an на място дисекция на органния блок, а техниката на Ghon включва дисекция на три отделни блока от органи - гръдния кош и цервикалната област, стомашно-чревни и коремни органи и урогенитални органи. [3] [6] Дисекцията на отделни органи включва достъп до зоната, в която се намира органът, и систематично премахване на анатомичните връзки на този орган със заобикалящата го среда. Например, при отстраняване на сърцето, връзки като горна празна вена и долна празна вена се разделят. Ако съществуват патологични връзки, като например фиброзен перикард, тогава той може да бъде умишлено дисектиран заедно с органа. [3]

Класическа античност Редактиране

Човешките дисекции са извършени от гръцките лекари Херофил от Халкидон и Еразистрат от Хиос в началото на трети век пр.н.е. [7] През този период е извършено първото изследване на пълната човешка анатомия, а не базово знание, придобито от задълбочаването на „проблем-решение“. [8] Въпреки че в гръцката култура имаше дълбоко табу по отношение на дисекцията на хора, по това време имаше силен тласък от правителството на Птолемей да изгради Александрия в център за научни изследвания. [8] За известно време римското право забранява дисекция и аутопсия на човешкото тяло, [9] така че лекарите трябваше да използват други трупове. Гален, например, дисектира макака Барбари и други примати, като приема, че тяхната анатомия е по същество същата като тази на хората. [10] [11] [12]

Индия Редактиране

Древните общества, които се коренят в Индия, оставят след себе си произведения на изкуството как да убиват животни по време на лов. [13] Изображенията, показващи как да убивате най-ефективно в зависимост от преследваната дивеч, предават интимни познания както за външната, така и за вътрешната анатомия, както и за относителната важност на органите. [13] Знанията са придобити най-вече чрез ловци, подготвящи наскоро уловената плячка. След като скитащият начин на живот вече не беше необходим, той беше заменен отчасти от цивилизацията, която се формира в долината на Инд. За съжаление, малко е останало от това време, което да покаже дали е настъпила дисекция или не, цивилизацията е била загубена за мигриращите арийски хора. [13]

В началото на историята на Индия (2-ри до 3-ти век) Арташастра описва 4-те начина, по които може да настъпи смъртта и техните симптоми: удавяне, обесване, удушаване или задушаване. [14] Според този източник аутопсия трябва да се извърши във всеки случай на преждевременна смърт. [14]

Практиката на дисекция процъфтява през 7-ми и 8-ми век. Под тяхно управление беше стандартизирано медицинското образование. Това създаде необходимост от по-добро разбиране на човешката анатомия, така че да имаме образовани хирурзи. Дисекцията беше ограничена от религиозното табу за рязане на човешкото тяло. Това промени подхода, възприет за постигане на целта. Процесът включваше разхлабване на тъканите в потоци вода, преди външните слоеве да бъдат отстранени с меки инструменти, за да достигнат до мускулатурата. За да усъвършенстват техниката на нарязване, бъдещите студенти използваха кратуни и тиква. Тези техники на дисекция доведоха до задълбочено разбиране на анатомията и им позволиха да завършат процедури, използвани днес, като ринопластика. [13]

През средновековието анатомичните учения от Индия се разпространяват в целия познат свят, но практиката на дисекция е закърнела от исляма. [13] Практиката на дисекция на университетско ниво не е наблюдавана отново до 1827 г., когато е извършена от студента Пандит Мадхусудан Гупта. [13] През 1900-те години преподавателите в университета трябваше непрекъснато да настояват срещу социалните табута на дисекцията, до около 1850 г., когато университетите решават, че е по-изгодно да обучават индийски лекари, отколкото да ги довеждат от Великобритания. [13] Индийските медицински училища обаче обучаваха жени лекари много преди тези в Англия. [13]

Сегашното състояние на дисекцията в Индия се влошава. Броят на часовете, прекарани в лаборатории за дисекция по време на медицинското училище, е намалял значително през последните двадесет години. [13] Бъдещето на обучението по анатомия вероятно ще бъде елегантна комбинация от традиционни методи и интегративно компютърно обучение. [13] Използването на дисекция в ранните етапи на медицинското обучение е доказано по-ефективно при запазването на предвидената информация от техните симулирани аналози. [13] Въпреки това, компютърно генерираният опит се използва като преглед на по-късните етапи. [13] Комбинацията от тези методи има за цел да засили разбирането и увереността на учениците в анатомията, предмет, който е позорно труден за овладяване. [13] Има нарастваща нужда от анатом – като се има предвид, че повечето лаборатории по анатомия се преподават от завършили, надяващи се да завършат степен по анатомия – за да продължи дългата традиция на обучението по анатомия. [13]

Ислямски свят Edit

От началото на ислямската вяра през 610 г. сл. Хр., [15] законът на шериата се прилага в по-голяма или по-малка степен в мюсюлманските страни [15] , подкрепян от ислямски учени като Ал-Газали. [16] Ислямски лекари като Ибн Зухр (Авензоар) (1091–1161) в Ал-Андалус, [17] лекарят на Саладин Ибн Джумай през 12 век, Абд ел-Латиф в Египет ок. 1200, [18] и Ибн ал-Нафис в Сирия и Египет през 13-ти век може да са практикували дисекция, [16] [19] [20] но остава неясно дали е практикувана дисекция на хора или не. Ибн ал-Нафис, лекар и мюсюлмански юрист, предполага, че „предписанията на ислямското право са ни обезкуражили от практиката на дисекция, заедно с каквото и състрадание е в нашия темперамент“, [4] посочвайки, че въпреки че няма закон срещу това , въпреки това беше необичайно. Ислямът повелява тялото да бъде погребано възможно най-скоро, с изключение на религиозни празници, и че няма други средства за изхвърляне като кремация. [15] Преди 10-ти век дисекцията не е правена на човешки трупове. [15] Книгата Ал-Тасриф, написана от Al-Zahrawi през 1000 г. сл. Хр., описва хирургичната процедура, която се различава от предишните стандарти. [21] Книгата е образователен текст по медицина и хирургия, който включва подробни илюстрации. [21] По-късно е преведен и заема мястото на Авицена Канонът на медицината като основно учебно средство в Европа от 12-ти до 17-ти век. [21] Имаше някои, които бяха готови да дисектират хората до 12-ти век, за да научат, след което това беше забранено. Това отношение остава неизменно до 1952 г., когато Ислямското училище по юриспруденция в Египет постановява, че „необходимостта позволява забраненото“. [15] Това решение позволява разследване на съмнителни смъртни случаи чрез аутопсия. [15] През 1982 г. е взето решението с фетва, че ако служи на справедливостта, аутопсията си заслужава недостатъците. [15] Въпреки че ислямът сега одобрява аутопсията, ислямската общественост все още не одобрява. Аутопсията е разпространена в повечето мюсюлмански страни за медицински и съдебни цели. [15] В Египет той заема важно място в съдебната структура и се преподава във всички медицински университети на страната. [15] В Саудитска Арабия, чийто закон е изцяло продиктуван от шериата, аутопсията се гледа лошо от населението, но може да бъде принудена в наказателни дела [15] човешка дисекция понякога се среща на университетско ниво. [15] Аутопсията се извършва за съдебни цели в Катар и Тунис. [15] Човешката дисекция присъства в съвременния ислямски свят, но рядко се публикува поради религиозната и социална стигма. [15]

Тибет Редактиране

Тибетската медицина развила доста сложни познания по анатомия, придобити от дългогодишен опит с човешка дисекция. Тибетците бяха възприели практиката на погребение на небето поради твърдата земя на страната, замръзнала през по-голямата част от годината, и липсата на дърва за кремация. Небесното погребение започва с ритуална дисекция на починалия и е последвано от храненето на частите на лешоядите по върховете на хълмовете. С течение на времето тибетските анатомични познания намериха своя път в Аюрведа [22] и в по-малка степен в китайската медицина. [23] [24]

Християнска Европа Edit

През цялата история на християнска Европа дисекцията на човешки трупове за медицинско образование е преживяла различни цикли на легализация и забрана в различни страни. Дисекцията е била рядкост през Средновековието, но е била практикувана, [25] с доказателства поне от 13-ти век. [26] [27] [28] Практиката на аутопсия в средновековна Западна Европа е „много слабо известна“, тъй като са оцелели малко хирургически текстове или запазени човешки дисекции. [29] Съвременен йезуитски учен твърди, че християнската теология е допринесла значително за възраждането на човешката дисекция и аутопсия, като предоставя нов социално-религиозен и културен контекст, в който човешкият труп вече не се разглежда като свещен. [26]

Едикт на Съвета на Тур от 1163 г. и декрет от началото на 14-ти век на папа Бонифаций VIII са погрешно идентифицирани като забрана на дисекция и аутопсия, неразбиране или екстраполация от тези едикти може да са допринесли за нежеланието да се извършват подобни процедури. [30] [a] Средновековието е свидетел на възраждането на интереса към медицинските изследвания, включително човешка дисекция и аутопсия. [31]

Фридрих II (1194–1250), императорът на Свещената Римска империя, постановява, че всеки, който учи за лекар или хирург, трябва да присъства на човешка дисекция, която ще се провежда не по-рядко от веднъж на всеки пет години. [8] Някои европейски страни започнаха да легализират дисекцията на екзекутирани престъпници за образователни цели в края на 13-ти и началото на 14-ти век. Мондино де Луци извършва първата записана публична дисекция около 1315 г. [8] По това време аутопсията се извършва от екип, състоящ се от лектор, който изнася лекции, Сектор, който прави дисекцията, и Остензор, който посочва характеристиките на интереси. [8]

Италианецът Galeazzo di Santa Sofia прави първата публична дисекция на север от Алпите във Виена през 1404 г. [32]

Везалий през 16 век извършва множество дисекции в своите обширни анатомични изследвания. Той беше често атакуван заради несъгласието си с мненията на Гален за човешката анатомия. Везалий е първият, който изнася лекции и дисектира трупа едновременно. [8] [33]

Известно е, че католическата църква е поръчала аутопсия на сиамски близнаци Джоана и Мелкиора Балестеро в Испаньола през 1533 г., за да се определи дали имат обща душа. Те открили, че има две различни сърца и следователно две души, въз основа на древногръцкия философ Емпедокъл, който вярвал, че душата живее в сърцето. [34]

Човешка дисекция е практикувана и от ренесансови художници. Въпреки че повечето избраха да се съсредоточат върху външните повърхности на тялото, някои като Микеланджело Буонароти, Антонио дел Полайоло, Бачо Бандинели и Леонардо да Винчи потърсиха по-задълбочено разбиране. Въпреки това, нямаше разпоредби за художниците да получат трупове, така че те трябваше да прибягват до неразрешени средства, както всъщност анатомите понякога правеха, като ограбване на гробове, отвличане на тела и убийство. [8]

Анатомизацията понякога се нареждаше като форма на наказание, както например през 1806 г. на Джеймс Халиган и Доминик Дейли след публичното им обесване в Нортхемптън, Масачузетс. [35]

В съвременна Европа дисекцията се практикува рутинно в биологични изследвания и образование, в медицинските училища и за определяне на причината за смъртта при аутопсия. Обикновено се счита за необходима част от обучението и по този начин се приема културно. Понякога предизвиква противоречия, както когато зоологическата градина в Одензе реши да направи дисекция на трупове на лъвове публично пред „самоизбрана публика“. [36] [37]

Великобритания Редактиране

Във Великобритания дисекцията остава изцяло забранена от края на римското завоевание и през Средновековието до 16-ти век, когато поредица от кралски едикти дават на определени групи лекари и хирурзи някои ограничени права за дисекция на трупове. Разрешението е доста ограничено: до средата на 18-ти век Кралският колеж на лекарите и Компанията на бръснарите-хирурзи са единствените две групи, на които е разрешено да извършват дисекции и има годишна квота от десет трупа между тях. В резултат на натиска на анатоми, особено в бързо развиващите се медицински училища, Законът за убийствата от 1752 г. позволява телата на екзекутирани убийци да бъдат разчленени за анатомични изследвания и образование. До 19-ти век това предлагане на трупове се оказва недостатъчно, тъй като държавните медицински училища нарастват, а частните медицински училища нямат легален достъп до трупове. Възникна процъфтяващ черен пазар на трупове и части от тялото, което доведе до създаването на професията на грабването на тела и скандалните убийства на Бърк и Хеър през 1828 г., когато 16 души бяха убити за труповете си, за да бъдат продадени на анатоми. Полученият обществен протест доведе до приемането на Закона за анатомията от 1832 г., който увеличи законното предлагане на трупове за дисекция. [38]

До 21-ви век наличието на интерактивни компютърни програми и променящите се обществени настроения доведоха до подновен дебат относно използването на трупове в медицинското образование. Peninsula College of Medicine and Dentistry в Обединеното кралство, основан през 2000 г., стана първото модерно медицинско училище, което провежда обучението си по анатомия без дисекция. [39]

Редактиране на САЩ

В Съединените щати дисекцията на жаби става често срещана в часовете по биология в колежа от 20-те години на миналия век и постепенно се въвежда в по-ранните етапи на образованието. До 1988 г. около 75 до 80 процента от американските ученици по биология в гимназията са участвали в дисекция на жаби, с тенденция към въвеждане в началните училища. Жабите най-често са от рода Рана. Други популярни животни за дисекция в гимназията по време на това проучване бяха сред гръбначните, феталните прасета, костурите и котките и сред безгръбначните, земните червеи, скакалците, раците и морските звезди. [40] Около шест милиона животни (2016) се дисектират всяка година в гимназиите на Съединените щати, без да се брои медицинското обучение и изследвания. Повечето от тях са закупени вече мъртви от кланици и ферми. [41]

Дисекцията в американските гимназии стана известна през 1987 г., когато ученичка от Калифорния, Дженифър Греъм, заведе дело, за да изиска училището си да й позволи да завърши алтернативен проект. Съдът постанови, че задължителните дисекции са разрешени, но Греъм може да поиска дисекция на жаба, умряла от естествени причини, а не на убита за целите на дисекция практическата невъзможност да се получи жаба, умряла от естествени причини, на практика нека Греъм се откаже от необходимата дисекция. Делото даде публичност на защитниците на дисекцията. Греъм се появява в реклама на Apple Computer от 1987 г. за софтуера за виртуална дисекция Operation Frog. [42] [43] Щатът Калифорния прие Закон за правата на студентите през 1988 г., изискващ студентите, които възразяват, да могат да завършват алтернативни проекти. [44] Отказът от дисекция се увеличава през 90-те години. [45]

В Съединените щати 17 щата [b] заедно с Вашингтон, окръг Колумбия, са приели закони или политики за избор на дисекция, които позволяват на учениците в началното и средното образование да се откажат от дисекция. Други щати, включително Аризона, Хаваи, Минесота, Тексас и Юта, имат по-общи политики за отказване на морални, религиозни или етични съображения. [46] За да преодолее тези опасения, гимназията J. W. Mitchell в Ню Порт Ричи, Флорида, през 2019 г. стана първата гимназия в САЩ, която използва синтетични жаби за дисекция в часовете си по природни науки, вместо запазени истински жаби. [47] [48] [49]

Що се отнася до дисекцията на трупове в бакалавърска степен и медицинско училище, традиционната дисекция се подкрепя от професори и студенти, с известно противопоставяне, което ограничава наличието на дисекция. Студентите от по-високо ниво, които са изпитали този метод заедно със своите преподаватели, са съгласни, че "Изучаването на човешката анатомия с цветни диаграми е едно нещо. Използването на скалпел и действителен, наскоро жив човек е съвсем различен въпрос." [50]

Начинът, по който се получават трупни екземпляри, се различава значително в зависимост от страната. [51] В Обединеното кралство даряването на труп е изцяло доброволно. Принудителното дарение играе роля в около 20 процента от екземплярите в САЩ и почти всички екземпляри, дарени в някои страни като Южна Африка и Зимбабве. [51] Държавите, които практикуват принудително даряване, могат да предоставят телата на мъртви престъпници или непотърсени или неидентифицирани тела за целите на дисекция. [51] Такива практики могат да доведат до неволно даряване на по-голям дял от бедните, бездомните и социалните изгнаници. [51] Труповете, дарени в една юрисдикция, могат също да бъдат използвани за дисекция в друга, независимо дали в щати в САЩ, [4] или внесени от други страни, като например от Либия. [51] Като пример за това как трупът се дарява доброволно, погребалната къща във връзка с програма за доброволно дарение идентифицира тяло, което е част от програмата. След дипломатически разговор с роднини по темата, тялото се транспортира до регистрирано съоръжение. Тялото се изследва за наличие на ХИВ и вируси на хепатит. След това се оценява за използване като "пресен" или "подготвен" образец. [4]

Трупните екземпляри за дисекция по принцип се изхвърлят чрез кремация. След това починалият може да бъде погребан в местно гробище. Ако семейството желае, пепелта на починалия се връща на семейството. [4] Много институти имат местни политики за ангажиране, подкрепа и честване на донорите. Това може да включва поставянето на местни паметници на гробището. [4]

Човешките трупове често се използват в медицината за преподаване на анатомия или хирургични инструкции. [4] [51] Труповете се избират според тяхната анатомия и наличност. Те могат да се използват като част от курсове за дисекция, включващи "пресен" образец, за да бъдат възможно най-реалистични - например при обучение на хирурзи. [4] Труповете могат също да бъдат предварително дисектирани от обучени инструктори. Тази форма на дисекция включва подготовка и съхранение на проби за по-дълъг период от време и обикновено се използва за преподаване на анатомия. [4]

Някои алтернативи на дисекцията могат да представят образователни предимства пред използването на животински трупове, като същевременно елиминират възприеманите етични проблеми. [52] Тези алтернативи включват компютърни програми, лекции, триизмерни модели, филми и други форми на технологии. Загрижеността за хуманното отношение към животните често е в основата на възраженията срещу дисекцията на животните. [53] Проучванията показват, че някои ученици неохотно участват в дисекция на животни от страх от реално или предполагаемо наказание или остракизъм от своите учители и връстници, а много от тях не говорят за своите етични възражения. [54] [55]

Една алтернатива на използването на трупове е компютърната технология. В Stanford Medical School софтуерът комбинира рентгенови, ултразвукови и MRI изображения за показване на екран, голям колкото тяло на маса. [56] Във вариант на това, подходът за „виртуална анатомия“, който се разработва в университета в Ню Йорк, студентите носят триизмерни очила и могат да използват посочващо устройство, за да „[намахат] през виртуалното тяло, неговите участъци са ярко оцветени като живи тъкан." Твърди се, че този метод е „динамичен като Imax [кино]“. [57]

Привържениците на методологиите за преподаване без животни твърдят, че алтернативите на дисекцията на животни могат да бъдат от полза за преподавателите чрез повишаване на ефективността на преподаване и намаляване на разходите за обучение, като същевременно предоставят на учителите по-голям потенциал за персонализиране и повторяемост на учебните упражнения. Тези, които подкрепят алтернативите на дисекция, посочват проучвания, които показват, че компютърно-базираните методи на преподаване „спестяват времето на академичния и неакадемичния персонал … се считат за по-евтини и за ефективен и приятен начин на обучение на студентите [и] … допринасят за значително намаляване при животинска употреба“, тъй като няма време за настройка или почистване, няма задължителни уроци по безопасност и няма наблюдение на лошото поведение с животински трупове, ножици и скалпели. [58] [59] [60]

Със софтуер и други методи, различни от животните, също няма скъпо изхвърляне на оборудване или отстраняване на опасни материали. Някои програми също така позволяват на преподавателите да персонализират уроците и включват вградени модули за тестове и тестове, които могат да проследяват представянето на учениците. Освен това животните (независимо дали мъртви или живи) могат да се използват само веднъж, докато неживотинските ресурси могат да се използват в продължение на много години – допълнителна полза, която може да доведе до значителни икономии на разходи за учителите, училищните райони и държавните образователни системи. [58]

Няколко рецензирани сравнителни проучвания, изследващи задържането на информация и представянето на ученици, които дисекция на животни и тези, които са използвали алтернативен метод на обучение, стигат до заключението, че образователните резултати на учениците, на които се преподават основни и усъвършенствани биомедицински концепции и умения, използващи неживотински методи, са еквивалентни или по-добри от тези на своите връстници, които използват животински лаборатории като дисекция на животни. [61] [62]

Някои доклади посочват, че увереността, удовлетворението и способността на учениците да извличат и съобщават информация са били много по-високи за тези, които са участвали в алтернативни дейности в сравнение с дисекцията. Три отделни проучвания в университети в Съединените щати установяват, че студентите, които моделират телесни системи от глина, са значително по-добри в идентифицирането на съставните части на човешката анатомия, отколкото техните съученици, които извършват дисекция на животни. [63] [64] [65]

Друго проучване установи, че учениците предпочитат да използват глинено моделиране пред дисекция на животни и се представят точно толкова добре, колкото техните кохорти, които дисектират животни. [66]

През 2008 г. Националната асоциация на учителите по биология (NABT) потвърди подкрепата си за дисекция на животни в класната стая, заявявайки, че те „Насърчават присъствието на живи животни в класната стая, като се съобразяват с възрастта и нивото на зрялост на учениците...NABT призовава учителите да бъдат съзнавайки, че алтернативите на дисекцията имат своите ограничения. NABT подкрепя използването на тези материали като добавки към образователния процес, но не като изключителен заместител на използването на действителни организми." [67]

Националната асоциация на учителите по наука (NSTA) „подкрепя включването на живи животни като част от обучението в класната стая по естествени науки K-12, тъй като наблюдението и работата с животни от първа ръка може да предизвика интерес на учениците към науката, както и общо уважение към живота, като същевременно засилва ключови концепции “ на биологичните науки. NSTA също така подкрепя предлагането на алтернативи за дисекция на студенти, които се противопоставят на практиката. [68]

Базата данни на NORINA изброява над 3000 продукта, които могат да се използват като алтернативи или добавки към употребата на животни в образованието и обучението. [69] Те включват алтернативи на дисекцията в училищата. InterNICHE има подобна база данни и система за заеми. [70]


Предметни области на ASJC Scopus

  • APA
  • Стандартно
  • Харвард
  • Ванкувър
  • Автор
  • BIBTEX
  • RIS

Функционална дисекция на протеинови комплекси, участващи в биологията на дрождовата хромозома, използвайки карта на генетично взаимодействие. / Колинс, Шон Р. Милър, Кайл М. Маас, Нанси Л. Рогуев, Асен Филингам, Джефри Чу, Клемент С. Шулдинер, Мая Гебия, Маринела Рехт, Джудит Шалс, Майкъл Динг, Хуиминг Сю, Хонг Хан, Джунхонг Ингварсдотир, Кристин Ченг, Бенджамин Андрюс, Бренда Буун, Чарлз Бъргер, Шели Л. Хитър, Фил Джанг, Джигуо Браун, Грант У. Ингълс, К. Джеймс Емили, Андрю Алис, К. Дейвид Точиски, Дейвид П. Вайсман, Джонатан С. Грийнблат , Джак Ф. Кроган, Неван Дж.

В: Природа, бр. 446, No 7137, 12.04.2007 г., с. 806-810.

Резултати от изследването: Принос към списанието › Статия › партньорска рецензия

T1 - Функционална дисекция на протеинови комплекси, участващи в биологията на дрождовата хромозома, използвайки карта на генетично взаимодействие

AU - Ингварсдотир, Кристин

N2 – Определянето на функционалните връзки между протеините е от решаващо значение за разбирането на почти всички аспекти на клетъчната биология. Мащабното идентифициране на протеинови комплекси осигури една важна стъпка към тази цел, но дори познаването на стехиометрията, афинитета и живота на всяко взаимодействие протеин-протеин не би разкрило функционалните връзки между и вътре в такива комплекси. Генетичните взаимодействия могат да предоставят функционална информация, която до голяма степен е невидима за наборите от данни за взаимодействието протеин-протеин. Тук представяме епистатичен миниматричен профил (E-MAP), състоящ се от количествени измервания по двойки на генетичните взаимодействия между 743 Saccharomyces cerevisiae гена, участващи в различни аспекти на хромозомната биология (включително репликация/ремонт на ДНК, хроматидна сегрегация и транскрипционна регулация). Този E-MAP разкрива, че физическите взаимодействия попадат в два добре представени класа, разграничени по това дали отделните протеини действат кохерентно, за да изпълняват обща функция. По този начин данните за генетичното взаимодействие позволяват да се дисектират функционално мулти-протеинови комплекси, включително Mediator, и да се организират отделни протеинови комплекси в пътища. В един път, дефиниран тук, ние показваме, че Rtt109 е основателят на нов клас хистон ацетилтрансферази, отговорни за Asf1-зависимо ацетилиране на хистон H3 върху лизин 56. Тази модификация от своя страна позволява на убиквитин лигазен комплекс, съдържащ кулина Rtt101, да осигуряват геномна цялост по време на репликацията на ДНК.

AB – Определянето на функционалните връзки между протеините е от решаващо значение за разбирането на почти всички аспекти на клетъчната биология. Мащабното идентифициране на протеинови комплекси осигури една важна стъпка към тази цел, но дори познаването на стехиометрията, афинитета и живота на всяко взаимодействие протеин-протеин не би разкрило функционалните връзки между и вътре в такива комплекси. Генетичните взаимодействия могат да предоставят функционална информация, която е до голяма степен невидима за наборите от данни за взаимодействието протеин-протеин. Тук представяме епистатичен профил на мини масив (E-MAP), състоящ се от количествени по двойки измервания на генетичните взаимодействия между 743 гена на Saccharomyces cerevisiae, участващи в различни аспекти на хромозомната биология (включително репликация/ремонт на ДНК, хроматидна сегрегация и транскрипционна регулация). Този E-MAP разкрива, че физическите взаимодействия попадат в два добре представени класа, разграничени по това дали отделните протеини действат кохерентно, за да изпълняват обща функция. По този начин, данните за генетичното взаимодействие правят възможно да се дисектират функционално мулти-протеинови комплекси, включително Mediator, и да се организират отделни протеинови комплекси в пътища. In one pathway defined here, we show that Rtt109 is the founding member of a novel class of histone acetyltransferases responsible for Asf1-dependent acetylation of histone H3 on lysine 56. This modification, in turn, enables a ubiquitin ligase complex containing the cullin Rtt101 to ensure genomic integrity during DNA replication.


Functional dissection of protein complexes involved in yeast chromosome biology using a genetic interaction map

Defining the functional relationships between proteins is critical for understanding virtually all aspects of cell biology. Large-scale identification of protein complexes has provided one important step towards this goal however, even knowledge of the stoichiometry, affinity and lifetime of every protein-protein interaction would not reveal the functional relationships between and within such complexes. Genetic interactions can provide functional information that is largely invisible to protein-protein interaction data sets. Here we present an epistatic miniarray profile (E-MAP) consisting of quantitative pairwise measurements of the genetic interactions between 743 Saccharomyces cerevisiae genes involved in various aspects of chromosome biology (including DNA replication/repair, chromatid segregation and transcriptional regulation). This E-MAP reveals that physical interactions fall into two well-represented classes distinguished by whether or not the individual proteins act coherently to carry out a common function. Thus, genetic interaction data make it possible to dissect functionally multi-protein complexes, including Mediator, and to organize distinct protein complexes into pathways. In one pathway defined here, we show that Rtt109 is the founding member of a novel class of histone acetyltransferases responsible for Asf1-dependent acetylation of histone H3 on lysine 56. This modification, in turn, enables a ubiquitin ligase complex containing the cullin Rtt101 to ensure genomic integrity during DNA replication.


What is functional dissection? - Биология

a Centre for Gene Regulation and Expression, School of Life Sciences, University of Dundee, Dundee, UK
E-mail: [email protected]

b Institute for Molecular Precision Medicine, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China

Резюме

Protein O-GlcNAcylation is an abundant post-translational modification of intracellular proteins with the monosaccharide н-acetylglucosamine covalently tethered to serines and threonines. Modification of proteins with O-GlcNAc is required for metazoan embryo development and maintains cellular homeostasis through effects on transcription, signalling and stress response. While disruption of O-GlcNAc homeostasis can have detrimental impact on cell physiology and cause various diseases, little is known about the functions of individual O-GlcNAc sites. Most of the sites are modified sub-stoichiometrically which is a major challenge to the dissection of O-GlcNAc function. Here, we discuss the application, advantages and limitations of the currently available tools and technologies utilised to dissect the function of O-GlcNAc on individual proteins and sites инвитро и in vivo. Additionally, we provide a perspective on future developments required to decipher the protein- and site-specific roles of this essential sugar modification.


Identification and Functional Dissection of Stress-responsive Genes in Cotton

Cotton is one of the most important fiber and oil crops. Abiotic stress (salt stress, drought stress, heat stress and chilling stress) and biotic stress (Verticillium wilt, fusarium wilt, pests) severely threaten cotton productivity. Most commercial cotton cultivars show poor resistance to Verticillium wilt, .

Cotton is one of the most important fiber and oil crops. Abiotic stress (salt stress, drought stress, heat stress and chilling stress) and biotic stress (Verticillium wilt, fusarium wilt, pests) severely threaten cotton productivity. Most commercial cotton cultivars show poor resistance to Verticillium wilt, resulting in decreased fiber quality and annual crop yield, with losses reaching 30%-80% in severe disease outbreaks. Additionally, global climate change, drought, heat, and chilling stress dramatically suppress cotton growth and productivity. To develop germplasm that are abiotic and biotic stress resistant remains enigmatic. For sustained cotton breeding, it is essential to develop elite cotton varieties with enhanced tolerance to biotic and abiotic stress, without reduction in quality.

The location of elite alleles and loci with increased tolerance to biotic and abiotic stress will accelerate cotton breeding. It is also possible to study such elite genes originating from wild cotton, sea island cotton, other stress-tolerant plants, or microorganisms to enhance cotton stress tolerance. The function of these candidate genes or loci can be verified by genetic and biochemical processes. Genetic and biochemical analyses confirm the function of these candidate genes or loci, which are aggregated to produce elite cotton germplasm material.

The goal of this Research Topic is to summarize the advances in elite gene screening and the production of germplasm material for cotton tolerance to abiotic and biotic stress.

Specific themes include, but not limited to:
• Summary of the progress about cotton abiotic and biotic stress study, present the main challenges faced by cotton stress tolerant breeding, as well as the solutions, and future breeding strategies (reviews on invitation)
• Identification and functional characterization of elite alleles controlling abiotic stress including drought, salt stress, and elite germplasm materials creation with improved stress tolerance but without production penalty
• Identification and functional characterization of effector from Verticillium wilt, fusarium wilt and interacted proteins in plants, creation disease-resistant materials using transgenic technology and gene editing
• Identification and functional characterization of elite alleles and loci related to abiotic and biotic stress through population, omics, and other analysis,

We specifically welcome field-based studies studying the effects of cotton stress in the field as supposed to the lab.

Studies falling into the categories below will not be considered for review, unless they are expanded and provide insight into the biological system or process being studied:

i) Descriptive collection of transcripts, proteins or metabolites, including comparative sets as a result of different conditions or treatments
ii) Descriptive studies that define gene families using basic phylogenetics and the assignment of cursory functional attributions (e.g. expression profiles, hormone or metabolites levels, promoter analysis, informatic parameters)
ii) Descriptive studies using -omics approaches

The Topic Editors would like to acknowledge Dr. Xiaoyang Ge from State Key Laboratory of Cotton Biology, Institute of Cotton Research of CAAS for his contribution in the organization of this Research Topic.

Ключови думи: Abiotic and Biotic Stress, Cotton, Verticillium wilt, Germplasm creation, Resistance

Важна забележка: All contributions to this Research Topic must be within the scope of the section and journal to which they are submitted, as defined in their mission statements. Frontiers reserves the right to guide an out-of-scope manuscript to a more suitable section or journal at any stage of peer review.


Признания

We are grateful to K. Tipton and M. Bassik for critically reading the manuscript, S. Gasser, B. Frey and Vincent Cheung for discussion, and G. Narlikar for reagents. We thank N. Datta, T. Punna, N. Thompson, M. Ballantine, N. Gabovic, A. Wind, K. Chin, Y. Xue, A. Chan, Y. Xue, T. Chan, M. Xan, M. Lim, H. Dalgleish, K. Vachon, L. Le, C. Sun, Z. Hassam, J. Rilestone and K. Takhar for technical assistance. We also thank S. Jackson, Z. Zhang, Vanessa Cheung, F. Winston, J. Erkmann and P. Kaufman for communicating results before publication. This research was supported by grants from Genome Canada and the Ontario Genomics Institute (J.F.G., A.E., C.B. and B.A.), the NIH (D.P.T.), the Howard Hughes Medical Institute (J.S.W.) and the Canadian Institute of Health Research (N.J.K., C.J.I. and G.W.B.). S.R.C. was funded by a fellowship from the Burroughs Wellcome Fund. N.J.K. is a Sandler Family Fellow.


SPECIFIC TARGETING OF GLUTAMATERGIC AND GABAERGIC BNST SUBPOPULATIONS

Glutamate and gamma-aminobutyric acid (GABA) are the principal excitatory and inhibitory neurotransmitters in the brain, respectively. The anterior and dorsal parts of the BNST are mostly comprised of GABAergic neurons, while the posterior and ventral parts of the BNST contain significant numbers of both glutamatergic and GABAergic neurons (Poulin et al., 2009). To target glutamatergic or GABAergic BNST subpopulations, most studies used the Vglut2 или Vgat gene (that encodes vesicular glutamate transporter 2 or vesicular GABA transporter, respectively) as the genetic marker, respectively (Bhatti et al., 2020 Jennings et al., 2013a 2013b), while some used Gad2 (encoding 65 kDa isoform of glutamic acid decarboxylase) to gain genetic access to GABAergic BNST neurons (Hao et al., 2019). Specifically, these studies used knock-in mouse lines expressing a bacterial recombinase Cre under the promoter of Vglut2, Vgat, или Gad2 in combination with viral tools that allow Cre-dependent expression of optogenetic or chemogenetic tools or fluorescent calcium indicators. Notably, all the studies have demonstrated that optogenetic stimulation of each neural population indeed evoked the anticipated excitatory or inhibitory responses in the postsynaptic neurons, confirming the tight correspondence between molecular and electrophysiological phenotypes.


Functional dissection of the NuA4 histone acetyltransferase reveals its role as a genetic hub and that Eaf1 is essential for complex integrity

The Saccharomyces cerevisiae NuA4 histone acetyltransferase complex catalyzes the acetylation of histone H4 and the histone variant Htz1 to regulate key cellular events, including transcription, DNA repair, and faithful chromosome segregation. To further investigate the cellular processes impacted by NuA4, we exploited the nonessential subunits of the complex to build an extensive NuA4 genetic-interaction network map. The map reveals that NuA4 is a genetic hub whose function buffers a diverse range of cellular processes, many not previously linked to the complex, including Golgi complex-to-vacuole vesicle-mediated transport. Further, we probe the role that nonessential subunits play in NuA4 complex integrity. We find that most nonessential subunits have little impact on NuA4 complex integrity and display between 12 and 42 genetic interactions. In contrast, the deletion of EAF1 causes the collapse of the NuA4 complex and displays 148 genetic interactions. Our study indicates that Eaf1 plays a crucial function in NuA4 complex integrity. Further, we determine that Eaf5 and Eaf7 form a subcomplex, which reflects their similar genetic interaction profiles and phenotypes. Our integrative study demonstrates that genetic interaction maps are valuable in dissecting complex structure and provides insight into why the human NuA4 complex, Tip60, has been associated with a diverse range of pathologies.

Фигури

Synthetic genetic-interaction map of five…

Synthetic genetic-interaction map of five NuA4 subunits. Genome-wide SL-SGA screens were performed using…

Eaf1-TAP purifies the NuA4 complex.…

Eaf1-TAP purifies the NuA4 complex. SDS-PAGE (gradient gel) and silver staining comparing NuA4…

NuA4 function impacts vesicle-mediated transport.…

NuA4 function impacts vesicle-mediated transport. (А) eaf1 Δ, yaf9 Δ, yng2 Δ, and…

NuA4 physically interacts with Msn4…

NuA4 physically interacts with Msn4 but does not regulate Msn4 binding to the…

Eaf1 is required for NuA4…

Eaf1 is required for NuA4 complex integrity. SDS-PAGE (gradient gel) and silver staining…

Eaf5 and Eaf7 form a subcomplex within NuA4. (A) Two-dimensional, hierarchical clustering of…


ASJC Scopus subject areas

  • APA
  • Стандартно
  • Харвард
  • Ванкувър
  • Автор
  • BIBTEX
  • RIS

Functional dissection of protein complexes involved in yeast chromosome biology using a genetic interaction map. / Collins, Sean R. Miller, Kyle M. Maas, Nancy L. Roguev, Assen Fillingham, Jeffrey Chu, Clement S. Schuldiner, Maya Gebbia, Marinella Recht, Judith Shales, Michael Ding, Huiming Xu, Hong Han, Junhong Ingvarsdottir, Kristin Cheng, Benjamin Andrews, Brenda Boone, Charles Berger, Shelley L. Hieter, Phil Zhang, Zhiguo Brown, Grant W. Ingles, C. James Emili, Andrew Allis, C. David Toczyski, David P. Weissman, Jonathan S. Greenblatt, Jack F. Krogan, Nevan J.

In: Nature , Vol. 446, No. 7137, 12.04.2007, p. 806-810.

Research output : Contribution to journal › Article › peer-review

T1 - Functional dissection of protein complexes involved in yeast chromosome biology using a genetic interaction map

AU - Ingvarsdottir, Kristin

N1 - Funding Information: Acknowledgements We are grateful to K. Tipton and M. Bassik for critically reading the manuscript, S. Gasser, B. Frey and Vincent Cheung for discussion, and G. Narlikar for reagents. We thank N. Datta, T. Punna, N. Thompson, M. Ballantine, N. Gabovic, A. Wind, K. Chin, Y. Xue, A. Chan, Y. Xue, T. Chan, M. Xan, M. Lim, H. Dalgleish, K. Vachon, L. Le, C. Sun, Z. Hassam, J. Rilestone and K. Takhar for technical assistance. We also thank S. Jackson, Z. Zhang, Vanessa Cheung, F. Winston, J. Erkmann and P. Kaufman for communicating results before publication. This research was supported by grants from Genome Canada and the Ontario Genomics Institute (J.F.G., A.E., C.B. and B.A.), the NIH (D.P.T.), the Howard Hughes Medical Institute (J.S.W.) and the Canadian Institute of Health Research (N.J.K., C.J.I. and G.W.B.). S.R.C. was funded by a fellowship from the Burroughs Wellcome Fund. N.J.K. is a Sandler Family Fellow. Copyright: Copyright 2015 Elsevier B.V., All rights reserved.

N2 - Defining the functional relationships between proteins is critical for understanding virtually all aspects of cell biology. Large-scale identification of protein complexes has provided one important step towards this goal however, even knowledge of the stoichiometry, affinity and lifetime of every protein-protein interaction would not reveal the functional relationships between and within such complexes. Genetic interactions can provide functional information that is largely invisible to protein-protein interaction data sets. Here we present an epistatic miniarray profile (E-MAP) consisting of quantitative pairwise measurements of the genetic interactions between 743 Saccharomyces cerevisiae genes involved in various aspects of chromosome biology (including DNA replication/repair, chromatid segregation and transcriptional regulation). This E-MAP reveals that physical interactions fall into two well-represented classes distinguished by whether or not the individual proteins act coherently to carry out a common function. Thus, genetic interaction data make it possible to dissect functionally multi-protein complexes, including Mediator, and to organize distinct protein complexes into pathways. In one pathway defined here, we show that Rtt109 is the founding member of a novel class of histone acetyltransferases responsible for Asf1-dependent acetylation of histone H3 on lysine 56. This modification, in turn, enables a ubiquitin ligase complex containing the cullin Rtt101 to ensure genomic integrity during DNA replication.

AB - Defining the functional relationships between proteins is critical for understanding virtually all aspects of cell biology. Large-scale identification of protein complexes has provided one important step towards this goal however, even knowledge of the stoichiometry, affinity and lifetime of every protein-protein interaction would not reveal the functional relationships between and within such complexes. Genetic interactions can provide functional information that is largely invisible to protein-protein interaction data sets. Here we present an epistatic miniarray profile (E-MAP) consisting of quantitative pairwise measurements of the genetic interactions between 743 Saccharomyces cerevisiae genes involved in various aspects of chromosome biology (including DNA replication/repair, chromatid segregation and transcriptional regulation). This E-MAP reveals that physical interactions fall into two well-represented classes distinguished by whether or not the individual proteins act coherently to carry out a common function. Thus, genetic interaction data make it possible to dissect functionally multi-protein complexes, including Mediator, and to organize distinct protein complexes into pathways. In one pathway defined here, we show that Rtt109 is the founding member of a novel class of histone acetyltransferases responsible for Asf1-dependent acetylation of histone H3 on lysine 56. This modification, in turn, enables a ubiquitin ligase complex containing the cullin Rtt101 to ensure genomic integrity during DNA replication.


Гледай видеото: Какво научих от нереализираните си цели? (Юни 2022).


Коментари:

  1. Doll

    Да, това разбираемо съобщение

  2. Elmoor

    Yes, a quite good variant

  3. Rourke

    Съжалявам, но според мен се правят грешки. Аз съм в състояние да го докажа.

  4. Torben

    глупости .. защо ..

  5. Merlin

    Той абсолютно не е прав



Напишете съобщение